С первых дней Великой Отечественной войны на территории Карело-Финской ССР шли ожесточенные бои Красной Армии с финские войсками. 1 октября 1941 года подразделения Красной Армии после тяжелых оборонительных боев оставили столицу Карело-Финской ССР – город Петрозаводск. Военной прифронтовой столицей республики стал город Беломорск, куда были эвакуированы партийные и государственные органы КФССР из оккупированных финнами районов.
Беломорск активно перестраивался на военный лад: в городе сформировали истребительный батальон для защиты города, созданы предприятия, необходимые для жизнедеятельности в военное время. Здесь же располагался штаб Карельского фронта. Командующим фронтом был назначен генерал-лейтенант В.А. Фролов. В 1944 году командование принял маршал К.А. Мерецков, под руководством которого Карелия была освобождена от захватчиков. В настоящее время в здании штаба находится музей Карельского фронта.
При Военном совете Карельского фронта в Беломорске действовал Штаб партизанского движения под руководством С.Я. Вершинина. Всего в годы войны на Карельском фронте действовало 19 постоянных партизанских отряда. Их база находилась в селе Лехта, расположенного недалеко от Беломорска.
ЦК Комсомола Карело-Финской ССР также был эвакуирован в Беломорск. Ю. В. Андропов продолжил свою основную деятельность в качестве первого секретаря ЦК ЛКСМ КФССР. Также он ведет работу по привлечению комсомольцев и молодежи к подготовке кадров для партизанской и подпольной деятельности на оккупированной территории.